Στο Τμήμα Διοίκησης Οργανισμών, Μάρκετινγκ και Τουρισμού λειτουργούν έξι (6) καινοτομικά Προγράμματα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ), με μεγάλη επιτυχία επί σειρά ετών:
- Μεταπτυχιακό στη Διοίκηση Επιχειρήσεων – ΜΒΑ
- Μεταπτυχιακό στη Διοίκηση Τουριστικών Επιχειρήσεων και Οργανισμών
- Μεταπτυχιακό στη Διοίκηση και Οργάνωση Εκπαιδευτικών Μονάδων
- Διατμηματικό μεταπτυχιακό στη Διοίκηση Μονάδων Υγείας και Πρόνειας
- Διατμηματικό μεταπτυχιακό στη Δημόσια Διοίκηση
- Διαϊδριματικό μεταπτυχιακό στον Θρησκευτικό και Προσκηνυματικό Τουρισμό